Bacterial communities in mining soils and surrounding areas under regeneration process in a former ore mine

Abstract Human activities on the Earth's surface change the landscape of natural ecosystems. Mining practices are one of the most severe human activities, drastically altering the chemical, physical and biological properties of the soil environment. Bacterial communities in soil play an important role in the maintenance of ecological relationships. This work shows bacterial diversity, metabolic repertoire and physiological behavior in five ecosystems samples with different levels of impact. These ecosystems belong to a historical area in Iron Quadrangle, Minas Gerais, Brazil, which suffered mining activities until its total depletion without recovery since today. The results revealed Proteobacteria as the most predominant phylum followed by Acidobacteria, Verrucomicrobia, Planctomycetes, and Bacteroidetes. Soils that have not undergone anthropological actions exhibit an increase ability to degrade carbon sources. The richest soil with the high diversity was found in ecosystems that have suffered anthropogenic action. Our study shows profile of diversity inferring metabolic profile, which may elucidate the mechanisms underlying changes in community structure in situ mining sites in Brazil. Our data comes from contributing to know the bacterial diversity, relationship between these bacteria and can explore strategies for natural bioremediation in mining areas or adjacent areas under regeneration process in iron mining areas.

Freshwater quality of a stream in agricultural area where organic compost from animal and vegetable wastes is used / Qualidade da água de um córrego em área agrícola onde é usado composto orgânico de resíduos animais e vegetais

ABSTRACT Organic compost from biomass residues constitutes a viable alternative for partial or total replacement of mineral fertilizers for growing vegetables. This study evaluated the effects of compost on the water quality of a stream used mainly for irrigation of agricultural crops cultivated in nearby soil that has been treated with organic compost produced by carcasses, animal and vegetable waste for the last ten years. We sampled water biannually for two years, 2013 and 2014, from five locations along the stream. Physical variables and some chemical variables were analyzed. We also analyzed the total number of coliforms (Escherichia coli). Bacterial populations were compared by carbon substrate consumption. Total phosphorus contents in the samples from 2014 exceeded 0.1 mg L-1. The concentrations of other chemical species analyzed and the results for the physical variables were in accordance with the expected values compared with national and international water quality standards. The environment showed differential carbon source consumption and a high diversity of microorganisms, but our results did not show any evidence that the applied compost is changing the microbial population or its metabolic activity. This study shows that the use of the organic compost in agricultural areas seen does not negatively influence the quality of surface water in the study area. These results are important because the process of composting animal and vegetable waste and the use of compost obtained can be an alternative sustainable for adequate destination of these wastes.

RESUMO Composto orgânico produzido a partir de biomassa residual constitui uma alternativa viável para a substituição parcial ou total de fertilizantes minerais no cultivo de hortaliças. Neste estudo foram avaliados os efeitos do composto, sobre a qualidade da água de um córrego, usado principalmente para a irrigação de culturas agrícolas cultivadas em solo nas proximidades, tratado nos últimos dez anos com composto orgânico produzido a partir de carcaças, resíduos animais e vegetais. Amostras de água foram coletadas semestralmente, em 2013 e 2014, em cinco pontos ao longo do córrego. Foram analisadas variáveis físicas, algumas variáveis químicas e o número total de coliformes (Escherichia coli). As populações bacterianas foram comparadas pelo consumo de substratos de carbono. Os teores de fósforo total nas amostras de 2014 ultrapassaram 0,1 mg L-1. As concentrações das demais espécies químicas analisadas e os resultados para as variáveis fisicas ficaram de acordo com valores estabelecidos em normas nacionais e internacionais de qualidade de água. O ambiente mostrou consumo diferencial de fontes de carbono e grande diversidade de micro-organismos, mas os resultados não mostraram qualquer evidência de que o composto aplicado seja o fator responsável pela alteração da população microbiana ou sua atividade metabólica. Este estudo mostra que o uso do composto orgânico em áreas agrícolas parece não influenciar negativamente a qualidade da água superficial na área estudada. Estes resultados são importantes porque o processo de compostagem de resíduos animais e vegetais e o uso do composto obtido podem ser uma alternativa sustentável para o destino adequado desses resíduos.

Leptospira spp. em bovinos leiteiros do estado do Maranhão, Brasil: frequência, fatores de risco e mapeamento de rebanhos reagentes / Leptospira spp. in dairy cattle of Maranhão state, Brazil: frequency, risk factors and mapping of reagent herds

O presente estudo teve como objetivo determinar a frequência, os fatores de risco e o mapeamento de focos em rebanhos leiteiros do estado do Maranhão, Brasil, associados à Leptospira spp. Foram colhidas 420 amostras de soros sanguíneos de fêmeas com idade ≥24 meses selecionadas de forma aleatória simples, distribuídas em 70 rebanhos provenientes de 14 municípios. Foi aplicado um questionário epidemiológico para investigar os principais fatores de riscos associados à infecção. As amostras foram submetidas à prova de soroaglutinação microscópica (SAM), sendo utilizados 24 sorovares de Leptospira spp. Das amostras analisadas, 70 (100%) para rebanhos e 420 (100%) para animais foram reagentes a pelo menos um dos sorovares de Leptospira spp., com títulos variáveis entre 100 e 800. Os sorovares mais prevalentes foram Patoc (410/420; 97%), Castellonis (351/420; 84%), Hardjo (347/420; 83%), Hebdomadis (335/420; 80%), Sentot (328/420; 78%), Wolffi (330/420; 79%), Icterohaemorrhagiae (300/420; 71%) e Pomona (286/420; 69%). As variáveis não realização de inseminação artificial, criação conjunta de caprinos, ovinos, equinos e caninos e maior taxa de nascimento de bezerros no período seco apresentaram associação estatística significativa (p<0,05) à ocorrência de animais sororreagentes para Leptospira interrogans e foram considerados fatores de risco. Os resultados revelaram elevados títulos aglutinantes para diversos sorovares de Leptospira no rebanho bovino leiteiro do estado do Maranhão. Esses resultados demonstram a necessidade de implementação de estratégias que consistem na realização de vacinações, preferencialmente com sorovares regionais, exames sorológicos, aquisição de animais de propriedades idôneas, efetivação de quarentena ao ingresso de novos animais e notificação da doença na Agência de Defesa Agropecuária do Estado.(AU)

The present study's aim was to determine frequency, risk factors and mapping outbreaks in dairy cattle of Maranhão state, Brazil, associated to Leptospira spp. Four hundred and twenty samples of blood serum from females were analyzed, age ≥24 months, selected in a random way, distributed in 70 herds from 14 townships. An epidemiological questionnaire was applied to investigate possible factors that could have been associated to the infection. Serum samples were submitted to the serum agglutination test (SAT). It was used 24 serovars from the Leptospira spp. complex. From the analyzed samples, 70 (100%) for herds and 420 (100%) for animals were reagent to at least one of the Leptospira spp. serovar, reaching titles between 100 and 800. The most prevalent serovars were Patoc (410/420; 97%), Castellonis (351/420; 84%), Hardjo (347/420; 83%), Hebdomadis (335/420; 80%), Sentot (328/420; 78%), Wolffi (330/420; 79%), Icterohaemorrhagiae (300/420; 71%) and Pomona (286/420; 69%). From the variables considered as risk factors, the not utilization of artificial insemination, mixed herds of goats, sheeps, equines and canines in the properties, and the birth of calves in the non-rainy period showed significant statistical association (p<0.05) to the risk of infection with Leptospira interrogans . The results show elevated levels of leptospirosis frequency in dairy cattle herd from Maranhão state. Therefore, there is a necessity to implement strategies consisting of vaccinations with region serovares and serological exams, establishment of quarantine for arrival of new animals, monitoring existent herds in the properties and notification of the disease to the State Animal Health Agency.(AU)

Frequência de brucelose bovina em rebanhos leiteiros e em seres humanos na região central do estado do Maranhão, Brasil / Frequency of brucellosis in bovine livestock dayre and humans in central region of the state of Maranhão, Brazil

Objetivou-se com este estudo estimar a frequência da brucelose em bovinos e em ordenhadores na região central do Maranhão. Foram escolhidas, no período de maio a outubro de 2013, de forma aleatória, 35 propriedades cadastradas na Agência Estadual de Defesa Agropecuária do Maranhão (AGED-MA) e analisados sorologicamente 525 bovinos com aptidão leiteira, hemossoros de 60 ordenhadores, além de ter sido aplicado questionário epidemiológico para investigar os fatores de risco associados à infecção. O protocolo de diagnóstico utilizado foi o teste de triagem com antígeno acidificado tamponado (AAT), e a confirmação dos reagentes ocorreu mediante os testes 2-mercaptoetanol (2-ME) e polarização fluorescente (TPF). A frequência de animais sororreagentes foi de 26/525 (4,95%) no teste AAT e 17/525 (3,23%) e 13/525 (2,47%) nos testes de 2-ME e TPF, respectivamente. A frequência de rebanhos foco, com pelo menos um animal soropositivo, foi de 9/35 (25,71%) e 8/3 (22,85%), nessa ordem. Referente aos ordenhadores, 1/60 (1,66%) foi reagente nos testes confirmatórios de 2-ME, TPF e fixação de complemento. O fator de risco associado à ocorrência da brucelose, na análise multivariada, foi presença de ovinos (odds ratio - OR=6,66; intervalo de confiança de 95% - IC95% 1,26-35,03). O estudo demonstrou que a brucelose está disseminada no rebanho leiteiro investigado, indicando a necessidade de melhorias nas ações de controle e erradicação da brucelose na região estudada.(AU)

The aim of this study was to estimate the frequency of bovine and human brucellosis in the middle region of Maranhão. Thirty-five properties, registered at Maranhão State Agency of Agriculture Defense (AGED-MA), were chosen randomly, between May and October of 2013. Then, 525 blood serum samples from dairy cattle and 60 from milkers were serologically analyzed and went through an epidemiological questionnaire to investigate the risk factors associated to the infection. The diagnosis protocol used was the trial test of rose Bengal test (RBT), and the confirmation of reactors was by 2-mercaptoethanol (2-ME) and fluorescence polarisation assay (FPA). The frequency of animals that tested positive was 26/525 (4.95%) at RBT, and 17/525 (3.23%) and 13/525 (2.47%) at 2-ME and FPA, respectively. The frequencies of foci herds, with at least one positive animal, were 9/35 (25.71%) and 8/3 (22.85%), respectively. Regarding the milkers, 1/60 (1.66%) reacted at the confirmatory tests such as 2-ME, FPA and complement fixation. The risk factor, associated to brucellosis occurrence, in the multivariate analysis, was the presence of sheep (odds ratio - OR = 6.66, confidence interval - 95%CI = 1.26-35.03). The study showed that brucellosis is disseminated in the investigated dairy herd, indicating the need of a better control and eradication actions forbrucellosis in the examined region.(AU)

Educação alimentar e nutricional na perspectiva da atenção primária à saúde / Food and nutrition education from the perspective of primary health care

Diante da relevância da obesidade como problema de saú- de pública e sabendo que as ações de promoção da saúde e hábitos saudáveis de alimentação são condutas eficazes para prevenir a evolução desse agravo, este estudo objeti- vou identificar as mudanças no estilo de vida a partir do processo educativo na percepção de participantes de um grupo de educação nutricional. Trata-se de uma pesquisa descritiva e explicativa, com abordagem qualitativa, sen- do constituída por seis sujeitos adultos, obesos, com ou sem comorbidades associadas que participaram do gru- po de educação nutricional desenvolvido em uma UBSF localizada na Zona Leste do município de São Paulo. As entrevistas foram guiadas por um roteiro semiestruturado e, posteriormente, transcritas na íntegra, categorizadas e analisadas a partir da técnica de análise de conteúdo pre- conizada por Bardin. Os discursos foram agrupados em seis categorias, que evidenciaram mudanças significativas e duradouras dos hábitos alimentares, com repercussão no âmbito familiar, além de novas significações para a prá- tica de atividade física. O trabalho em grupo possibilitou a troca entre os saberes formais e populares e mostrou-se um recurso interessante para se conduzir o processo de educação em saúde, favorecendo as mudanças no estilo de vida. Torna-se relevante a valorização dessa ferramenta de trabalho pelos profissionais da atenção básica a fim de tornar as ações mais efetivas.

Given the importance of obesity as a public health problem and knowing that health promotion actions and healthy eating habits are effective actions in preventing the evolution of this harmful condition, this study aimed to identify changes in lifestyle stemming from the educational process in the perception of participants of a nutrition education group. This is a descriptive and explanatory study, with a qualitative approach, and is composed of six obese adult subjects, with or without associated co-morbidities, who participated in the nutrition education group developed at a Basic Family Health Unit located in the Eastern District of the city of São Paulo. The interviews were guided by a semi- structured script, and later fully transcribed, categorized, and analyzed based on the content analysis technique proposed by Bardin. The discourses were grouped into six categories that showed significant and lasting changes in eating habits, with repercussions in the family setting, and new emphasis on the practice of physical activity. Group work facilitated exchange between formal and popular knowledge, and proved to be a useful resource in the process of health education, encouraging changes in lifestyle. The recognition of this tool by primary care professionals is relevant to increasing the effectiveness of their work.

Reflexões sobre o inquietante de ser portador de HIV/Aids / Reflections on the uneasiness of living with HIV/Aids

O HIV/Aids para o indivíduo parece ser representado como um estrangeiro inimigo que invade o organismo e produz efeitos da ordem do que é inquietante por reaver complexos infantis de castração, pois muitas são as novas imposições a partir desse diagnóstico: perda de peso, fragilidade imunológica, impossibilidades à relação sexual e a própria possibilidade iminente de morte. Além disso, o HIV/Aids parece trazer consigo o agravante do sexual - bem como suas representações no imaginário cultural -, pois esta é ainda hoje é uma das principais vias de contágio. É acerca desse indivíduo que se propõe pensar uma interlocução entre o diagnóstico de Aids e o sentimento de estranheza na teoria freudiana.

For the individual HIV/Aids appears to be represented as an foreigner that invades the body and produces effects on the order of what is unsettling, since it recovers childhood's castration complex. There are many new impositions from this diagnosis: weight loss, a weakened immune system, impossibilities to intercourse and the very real possibility of imminent death. Furthermore, HIV/Aids seem to carry the additional burden of a sexual element - and its representations in cultural imaginary - because today this is still a major route of infection. It is regarding this individual that we propose a dialogue between the Aids diagnosis and the feeling of weirdness in Freudian theory.

Qualidade microbiológica da água de escolas públicas do município de Rosário, MA / Microbiological water quality of public schools in the city of Rosario, MA

A água potável é um suprimento indispensável para a qualidade de vida de qualquer indivíduo. O objetivo deste estudo foi avaliar a qualidade microbiológica da água das Escolas Públicas do município de Rosário – MA, de agosto de 2007 a janeiro de 2008, utilizando a técnica do Número Mais Provável (NMP/mL) de coliformes totais, coliformes termotolerantes, Pseudomonas aeruginosa e contagem de bactérias heterotróficas mesófilas, segundo a metodologia recomendada pela CETESB, 1996. Os resultados das análises evidenciaram que, em quatro (57,14%) escolas a água estava contaminada por coliformes totais, duas (28,57%) por termotolerantes, cinco (71,42%) por Pseudomonas, enquanto uma (14,28%) apresentou contagem de bactérias heterotróficas acima do limite aceitável.

A percepção dos profissionais e usuários da estratégia de saúde da família sobre os grupos de promoção da saúde / Family health strategy professionals and users' perception on health promotion groups / La percepción de los profesionales y usuarios de la estrategia de salud de la família sobre los grupos de promoción de la salud

Pesquisa qualitativa participativa, que objetivou conhecer a percepção dos usuários e profissionais da Estratégia Saúde da Família sobre grupos de saúde desenvolvidos num município do Sul do Brasil. Utilizou-se o itinerário freireano em seis círculos de cultura com usuários/profissionais de duas equipes, sendo investigados 24 temas e desvelados em duas temáticas significativas, analisados à luz da Carta de Ottawa. Os resultados indicaram que as ações de promoção da saúde realizadas nestes grupos estão fortemente alinhadas com a reorientação dos serviços de saúde e o desenvolvimento de habilidades pessoais. As ações de lazer efetuadas mostram indícios de intersetorialidade e participação social. A metodologia utilizada possibilitou aproximações entre profissionais/usuários, e diálogo em torno das situações e temáticas levantadas. Conclui-se que as ações de promoção necessitam ser ampliadas nestes grupos e que o círculo de cultura proposto por Paulo Freire é uma ferramenta possível à construção de práticas de saúde mais participativas e emancipatórias.

In this participative and qualitative research, the aim was to get to know how Family Health Strategy users and professionals perceive health groups developed in a city in Southern Brazil. For collecting the data, Freire's itinerary was used in six culture circles with professionals/users of two teams. Twenty-four themes were investigated and unveiled in two major themes, which were analyzed based on the Ottawa Charter. The study results showed that health promotion actions developed in these groups are strongly connected to the reorientation of the health services and the development of personal skills. The leisure actions developed have shown some cross-sector relations and social participation. The method used in this research permitted approximations between professionals/users, as well as dialogue about the situations and themes brought up. It was concluded that health promotion actions need to be expanded in these groups and that the culture circle Paulo Freire proposed is a possible tool for the construction of participatory and emancipatory health practices.

Esta es una investigación cualitativa participativa que tuvo como objetivo saber la opinión de los usuarios y del equipo de la estrategia salud de la familia acerca de los grupos de salud desarrollados en una ciudad en el sur de Brasil. Para la recolección de los datos se utilizó el Itinerario Freireano en seis círculos de cultura con usuarios/profesionales de dos equipos, se investigaron 24 temas y se priorizaron en dos temas significativos con sus análisis basados en la Carta de Ottawa. Los resultados mostraron que las acciones de promoción de salud realizadas en estos grupos están fuertemente dirigidas a la "reorientación de los servicios de salud" y el "desarrollo de habilidades personales". Las acciones libres desarrolladas muestran aspectos de intersectorialidad y participación social. La metodología utilizada posibilitó aproximaciones entre profesionales y usuarios, y también el diálogo en torno a situaciones y temáticas detectadas. Se concluye que las acciones de promoción de la salud todavía necesitan ser ampliadas en estos grupos y que los círculos de cultura propuestos por Paulo Freire son una posible herramienta para la construcción de prácticas de salud participativa y de emancipación.

Qualidade bacteriológica e físico-química da água de poços para o consumo humano no Estado do Maranhão / Bacteriological quality and physico-chemical water wells for human consumption in the state of Maranhão

A presente pesquisa teve como objetivo avaliar a qualidade bacteriológica e físico-química da água de poços de municípios do estado do Maranhão. Foram realizadas determinações bacteriológicas de coliformes totais e Escherichia coli, contagem de bactérias heterotróficas aeróbias mesófilas e físico-químicas de pH, dureza total, cloretos e turbidez.. Os resultados demonstraram que 40,38% das amostras se encontraram contaminadas por coliformes totais, 11,53% por E. coli e 13,46% apresentaram mais de 500 Unidades Formadoras de Colônias (UFC)/mL. Considerando-se os valores máximos permissíveis para os parâmetros físico-químicos foram obtidos os seguintes resultados: 0,96% das amostras apresentaram valor de dureza total elevado, 4,80% e 14,42% valores de cloretos e turbidez, respectivamente. Todas as amostras apresentaram pH dentro dos limites determinados pela legislação. Os resultados reforçam a importância da água de poços como veiculadora de micro-organismos para a população.

Microbiological water quality and gill histopathology of fish from fish farming in Itapecuru-Mirim County, Maranhão State - doi: 10.4025/actascibiolsci.v34i2.8460

The present study evaluated the microbiological water quality and tissue lesions in gills from Nile tilapia (Oreochromis niloticus) and hybrid tambacu (Colossoma macropomum female x Piaractus mesopotamicus male). For this, water and gills were collected from fish farming at six locations in Itapecuru-Mirim County, Maranhão State. Microbiological water analyses revealed contamination by total coliforms, Escherichia coli and heterotrophic bacteria. In the gills, we observed a diversity of Gram-positive and Gram-negative bacteria. The tissue lesions were: lamellar fusion, interlamellar hyperplasia, sub-epithelial edema and telangiectasia. Inflammatory lesions were not observed. Significant statistical difference (p > 0.05) was not detected when comparing different gills lesions during rainy and dry season. The correlation between lesion and pond type was statistically different (p 0.05) for lamellar fusion and interlamellar hyperplasia which occurred more frequently at ground ponds. Regarding the frequency of lesions in the different fish species, there was statistical difference (p 0.05), and the tambacu was more sensitive to lamellar fusion while tilapia was more sensitive for the other lesions. In relation to the sampling stations, there was statistical difference for all the gill lesions. In conclusion, tissue lesions are nonspecific and function as a defense mech

Microbiological water quality and gill histopathology of fish from fish farming in Itapecuru-Mirim County, Maranhão State / Qualidade microbiológica da água e histopatologia de brânquias de peixes provenientes de pisciculturas do município de Itapecuru-Mirim, Estado do Maranhão

The present study evaluated the microbiological water quality and tissue lesions in gills from Nile tilapia (Oreochromis niloticus) and hybrid tambacu (Colossoma macropomum female x Piaractus mesopotamicus male). For this, water and gills were collected from fish farming at six locations in Itapecuru-Mirim County, Maranhão State. Microbiological water analyses revealed contamination by total coliforms, Escherichia coli and heterotrophic bacteria. In the gills, we observed a diversity of Gram-positive and Gram-negative bacteria. The tissue lesions were: lamellar fusion, interlamellar hyperplasia, sub-epithelial edema and telangiectasia. Inflammatory lesions were not observed. Significant statistical difference (p > 0.05) was not detected when comparing different gills lesions during rainy and dry season. The correlation between lesion and pond type was statistically different (p < 0.05) for lamellar fusion and interlamellar hyperplasia which occurred more frequently at ground ponds. Regarding the frequency of lesions in the different fish species, there was statistical difference (p < 0.05), and the tambacu was more sensitive to lamellar fusion while tilapia was more sensitive for the other lesions. In relation to the sampling stations, there was statistical difference for all the gill lesions. In conclusion, tissue lesions are nonspecific and function as a defense mechanism against polluted aquatic environments, without infectious character.

Com o objetivo de avaliar a qualidade microbiológica da água e as alterações teciduais em brânquias de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) e do híbrido tambacu (Colossoma macropomum fêmea x Piaractus mesopotamicus macho), coletou-se água de pisciculturas e brânquias de peixes de seis localidades do município de Itapecuru-Mirim, Estado do Maranhão. O exame microbiológico da água revelou poluição por coliformes totais, Escherichia coli e bactérias heterotróficas. Nas brânquias, observou-se uma variedade de bactérias Gram-positivas e negativas. As alterações teciduais observadas foram fusão de lamelas, hiperplasia interlamelar, edema subepitelial e telangiectasia, não sendo observadas lesões inflamatórias. Não houve diferença estatística (p > 0,05) quando se comparou diferentes tipos de lesões branquiais com os períodos de chuva ou de seca. A correlação de lesões e tipos de tanque demonstrou diferença estatística (p < 0,05) para fusão de lamelas e hiperplasia interlamelar que ocorreram com maior frequência em viveiro de terra. Quanto à frequência de lesões nas diferentes espécies de peixe, houve diferença estatística (p < 0,05), sendo o tambacu mais sensível para fusão de lamelas, enquanto que na tilápia as demais lesões foram mais frequentes. Em relação aos pontos de coleta, houve diferença estatística para todas as alterações branquiais. As alterações teciduais encontradas são inespecíficas e agem como mecanismo de defesa frente ao ambiente aquático poluído, mas sem demonstrar caráter infeccioso.

Production of DNA microarray and expression analysis of genes from Xylella fastidiosa in different culture media

DNA Microarray was developed to monitor the expression of many genes from Xylella fastidiosa, allowing the side by-side comparison of two situations in a single experiment. The experiments were performed using X. fastidiosa cells grown in two culture media: BCYE and XDM2. The primers were synthesized, spotted onto glass slides and the array was hybridized against fluorescently labeled cDNAs. The emitted signals were quantified, normalized and the data were statistically analyzed to verify the differentially expressed genes. According to the data, 104 genes were differentially expressed in XDM2 and 30 genes in BCYE media. The present study showed that DNA microarray technique efficiently differentiate the expressed genes under different conditions.

DNA Microarray foi desenvolvida para monitorar a expressão de muitos genes de Xylella fastidiosa, permitindo a comparação de duas situações distintas em um único experimento. Os experimentos foram feitos utilizando células de X. fastidiosa cultivada em dois meios de cultura: BCYE e XDM2. Pares de oligonucleotídeos iniciadores foram sintetizados, depositados em lâminas de vidro e o arranjo foi hibridizado contra cDNAs marcados fluorescentemente. Os sinais emitidos foram quantificados, normalizados e os dados foram estatisticamente analisados para verificar os genes diferencialmente expressos. De acordo com nossos dados, 104 genes foram diferencialmente expressos para o meio de cultura XDM2 e 30 genes para o BCYE. No presente estudo, nós demonstramos que a técnica de DNA microarrays eficientemente diferencia genes expressos sob diferentes condições de cultivo.

Xylella fastidiosa gene expression analysis by DNA microarrays

Xylella fastidiosa genome sequencing has generated valuable data by identifying genes acting either on metabolic pathways or in associated pathogenicity and virulence. Based on available information on these genes, new strategies for studying their expression patterns, such as microarray technology, were employed. A total of 2,600 primer pairs were synthesized and then used to generate fragments using the PCR technique. The arrays were hybridized against cDNAs labeled during reverse transcription reactions and which were obtained from bacteria grown under two different conditions (liquid XDM2 and liquid BCYE). All data were statistically analyzed to verify which genes were differentially expressed. In addition to exploring conditions for X. fastidiosa genome-wide transcriptome analysis, the present work observed the differential expression of several classes of genes (energy, protein, amino acid and nucleotide metabolism, transport, degradation of substances, toxins and hypothetical proteins, among others). The understanding of expressed genes in these two different media will be useful in comprehending the metabolic characteristics of X. fastidiosa, and in evaluating how important certain genes are for the functioning and survival of these bacteria in plants.

Avaliação da qualidade higiênico-sanitária da água utilizada em abatedouros de bovinos e suínos / Evaluation of hygienic-sanitary quality of water used in abattoirs of cattle and swine

Com o objetivo de verificar a qualidade higiênico-sanitária da água utilizada em abatedouros de bovinos e suínos, realizou-se a contagem de coliformes totais e termotolerantes, a pesquisa de Escherichia coli e Pseudomonas aeruginosa, em 54 amostras de água não tratada, perfazendo um total de 216 análises, provenientes de diferentes pontos de dois abatedouros de bovino e um abatedouro de suíno. Aplicou-se uma ficha de coleta para evidenciar as práticas higiênico-sanitárias de cada abatedouro. As amostras foram processadas utilizando-se a Técnica da Membrana Filtrante, segundo APHA (1998) e a identificação de coliformes totais e termotolerantes em meio Agar M-Endo Les e Agar M-FC, respectivamente; para o isolamento de E. coli utilizou-se o Agar EMB e a caracterização bioquímica foi feita utilizando o Enterokit B. Para a pesquisa de P. aeruginosa utilizou-se o Agar cetrimide. Das amostras coletadas, 52 (96,29 por cento) estavam contaminadas por coliformes totais e 31 (57,40 por cento) por coliformes termotolerantes. As amostras sugestivas para E. coli, na avaliação bioquímica todas foram negativas, evidenciando outros microrganismos do grupo termotolerantes (klebsiella e Enterobacter). As amostras analisadas para P. aeruginosa apresentaram resultados negativos. A água utilizada nos abatedouros em estudo, apresenta condições higiênico-sanitárias insatisfatórias.